群體進化

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解析種群信息,揭示群體進化歷程。

群體進化研究是指通過全基因組重測序技術獲得某物種自然群體各亞群的基因組信息,
通過與參考基因組比對,得到大量高準確性的SNP、InDel、SV、CNV等變異信息,
然后基于群體變異信息,討論群體的遺傳結構、基因交流情況、物種形成機制以及群體進化動態
等生物學問題, 從而從分子層面深入研究該物種的進化歷程。

追溯種群歷史,尋找進化基因。

基于全基因組重測序的群體進化研究,能夠最大程度地挖掘出群體內的遺傳變異,
可用來追溯群體的進化過程,挖掘進化基因,已廣泛應用于許多物種的人工馴化機制研究、
自然選擇機制分析和種群歷史研究。具有重要的科學理論和實踐應用價值。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

利用全基因組重測序技術獲得物種自然群體各
亞群的基因組信息,得到大量的SNP、InDel、
CNV等標記信息,隨后基于SNP和CNV
標記探討群體的遺傳結構等生物學問題。

分析內容 解決問題
變異檢測 準確定位 SNP、Indel、CNV 等變異位點
(Tree、PCA、Structure)
群體結構分析 構建系統進化樹,進行 PCA 和遺傳結構分析,確定樣本間進化關系
遺傳多樣性分析 完成群體θπ、θw多態性參數的估算
選擇性消除分析 不同群體進化過程中的選擇性消除,揭示與選擇相關的關鍵基因
基因功能注釋與富集分析 統計候選基因分布規律,尋找性狀相關的功能基因
種群歷史分析 討論樣本支系之間的分化歷史,結合歷史事件,可以講述非常動聽的生物學故事
基因交流分析 為研究群體進化過程中的遷移事件提供思路

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

群體進化研究采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

至2019年8月,諾禾致源已完成藏豬、金絲猴、綿羊、西域飛蝗、
桃子、小麥等幾十個物種的群體進化研究,文章多發表于Nature Genetics、Nature Communications等國際頂級期刊。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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